Kniha Anna zo Zeleného domu rozpráva príbeh 12-ročnej siroty menom Anna Shirleyová. Anna má bledú pleť, veľa pieh a ryšavé vlasy, za ktoré sa zo začiatku hanbí, no postupne sa naučí mať rada samu seba takú, aká je. Je veľmi zhovorčivá, citlivá a má bohatú fantáziu – rada si predstavuje rôzne príbehy a často si vymýšľa krajšiu verziu reality, čo jej pomáha zvládať ťažké chvíle.
Jedného dňa sa dostane na farmu Zelený dom, kde ju omylom adoptujú súrodenci Marilla a Matej Cuthbertovci, ktorí pôvodne chceli chlapca aby pomáhal Matejovi na poliach veď sám nebol najmladší. Napriek tomuto nedorozumeniu si Annu postupne obľúbia a rozhodnú sa, že si ju nechajú. Anna si začína budovať nový život, spoznáva nové prostredie, školu aj priateľov. Najbližšou sa jej stane Diana Barryová, s ktorou prežíva množstvo veselých aj dojímavých chvíľ. Hlavným ,,rivalom“ sa stane Gilbert, ktorý ju hneď v prvý deň nazve mrkvou. Anna nevie kontrolovať hnev a tak mu rozbije tabuľku o hlavu. Gilbert sa snaží celú knihu uzmieriť s Annou, len sa mu to moc nedarí. Anna je veľmi tvrdohlavá a rada s ním súťaží. Na konci knihy keď Matej zomrie sa s Gilbertom konečne spriatelia.
Počas príbehu Anna dospieva, učí sa zo svojich chýb a snaží sa byť lepším človekom. Často sa dostáva do rôznych nepríjemných, ale aj vtipných situácií, najmä kvôli svojej impulzívnosti a veľkej fantázii. Práve tieto momenty robia knihu zaujímavou a živou. Veľký dôraz sa kladie na priateľstvo, rodinu, vzdelanie a schopnosť vidieť krásu aj v obyčajných veciach každodenného života.