Kniha Anna zo Zeleného domu je o dievčati, ktoré sa volá Anna Shirley. Je sirota a celý život putovala z jedného domova do druhého, kde sa o ňu poriadne nikto nestaral. Jedného dňa sa stane chyba – súrodenci Marilla a Matthew Cuthbertovci, ktorí žijú na farme v dedine Avonlea, si chceli adoptovať chlapca, aby im pomáhal s prácou, ale omylom im poslali Annu.
Anna je veľmi zvláštna. Veľmi veľa rozpráva, má obrovskú predstavivosť a vždy má plnú hlavu nápadov. Najskôr ju Marilla nechce prijať, ale nakoniec sa rozhodne, že si ju nechajú. Anna sa tak presťahuje do ich domu, ktorý sa volá Zelený dom, a začne nový život.
Zo začiatku to nie je ľahké. Anna sa dostáva do rôznych problémov – napríklad si omylom zafarbí vlasy nazeleno alebo ponúkne kamarátke víno namiesto malinovky. Ale postupne si ju všetci v dedine obľúbia, aj keď je trochu iná než ostatné dievčatá.
Anna si nájde najlepšiu kamarátku Dianu a tiež sa začne hádať s chlapcom Gilbertom, ktorý ju naštval, keď jej raz povedal, že má mrkvové vlasy. Oni dvaja spolu vždy súperia v škole, ale neskôr sa ich vzťah začne meniť.
Príbeh ukazuje, ako Anna dospieva, učí sa robiť správne rozhodnutia a ako sa z nej stáva milé a múdre dievča. Aj keď zažije aj smutné chvíle, napríklad keď stratí niekoho blízkeho, vždy sa snaží pozerať na svet s nádejou a radosťou.