V šiestom diely sa Voldemortova moc rýchlo šíri – čarodejnícky aj muklovský svet zažívajú chaos. Harry sa vracia na Rokfort, kde Dumbledore začína s Harrym intenzívne pracovať na porozumení Voldemortovej minulosti. Pomocou spomienok zisťujú, že Voldemort rozdelil svoju dušu do viacerých častí – tzv. horcruxov. Aby ho mohli poraziť, musia všetky horcruxy nájsť a zničiť.
Harry zároveň objaví starú učebnicu elixírov, ktorá patrila záhadnému „Polovičnému princovi“ a obsahuje množstvo užitočných poznámok. Vďaka nej sa stáva najlepším žiakom elixírov. Zároveň sa medzi ním a Ginny Weasleyovou začína rodiť cit. Napätie rastie aj s Dracom Malfoyom, ktorý niečo skrýva a správa sa čoraz podozrivejšie.
Na konci knihy sa Dumbledore a Harry vydajú získať jeden z horcruxov, no Dumbledore po návrate zoslabne. Rokfort napadnú smrťožrúti, Malfoy odhalí svoju úlohu a nakoniec Severus Snape – ktorého Harry považoval za zradcu – Dumbledora zabije. Ukáže sa, že Snape je Polovičný princ.
