Harry začína šiesty ročník na Rokforte v čase, keď Lord Voldemort naberá silu a čarodejnícky svet je v nebezpečenstve. Riaditeľ Albus Dumbledore ho začne intenzívne pripravovať na boj tým, že mu ukazuje spomienky z Voldemortovej minulosti. Harry zistí, že Voldemort rozdelil svoju dušu na viaceré časti, nazývané horcruxy, ktoré musia byť zničené, aby ho bolo možné poraziť. V škole sa Harrymu darí v elixíroch vďaka starej knihe patrícej „Polovičnému princovi“, ktorý sa neskôr ukáže ako Severus Snape. Medzitým Draco Malfoy plní tajnú úlohu od Voldemorta a snaží sa dostať smrťožrútov do Rokfortu. Na konci Dumbledore a Harry získajú jeden horcrux. Po návrate na školu dôjde k útoku smrťožrútov. Dumbledore je oslabený a Snape ho zabije, čo otrasie Harrym aj celým svetom. Harry sa rozhodne nevrátiť do školy a vydá sa na cestu, aby zničil zvyšné horcruxy a porazil Voldemorta.
