Príbeh rozpráva pilot, ktorý havaruje so svojím lietadlom na púšti. Tam stretne zvláštneho chlapca – Malého princa, ktorý pochádza z malej planéty B-612. Malý princ mu postupne rozpráva o svojom živote, o svojej planéte a o ruži, ktorú miloval, ale nerozumel jej.
Na svojej ceste po vesmíre navštívil viacero planét, kde stretol rôznych dospelých – napríklad kráľa, márnivca, pijana či biznismena. Každá z týchto postáv symbolizuje určité ľudské vlastnosti a slabosti, najmä nezmyselnosť správania dospelých.
Na Zemi stretne líšku, ktorá ho naučí dôležitú myšlienku: „Dobre vidíme iba srdcom. To podstatné je očiam neviditeľné.“ Vďaka nej pochopí hodnotu priateľstva, lásky a zodpovednosti za to, čo si „ochočíme“.
Na konci príbehu sa Malý princ rozhodne vrátiť na svoju planétu a k svojej ruži. Pilot zostáva sám, ale navždy si uchová spomienku na ich stretnutie a ponaučenie, ktoré mu Malý princ dal.