Príbeh sleduje malého chlapca , ktorý po tragickej autonehode prichádza o rodičov a zostáva žiť so svojou láskavou, ale prísnou nórskou starou mamou. Tá ho učí o čarodejniciach – nie však tých z rozprávok, ale skutočných, nebezpečných čarodejniciach, ktoré nenávidia deti a snažia sa ich zničiť. Skutočné čarodejnice sú podľa babičkiných opisov dokonale maskované ako bežné ženy, no majú niekoľko charakteristických znakov – nosia rukavice, aby skryli pazúry, parochne, pretože sú plešaté, a majú modré sliny a veľmi dobrý čuch na deti. Chlapec a jeho babička sa rozhodnú ísť na luxusnú dovolenku a tak sa ubytujú v hoteli v Anglicku, kde sa náhodou chlapec stane svedkom tajného stretnutia čarodejníc. Na čele stojí Veľká čarodejnica, najvyššia a najnebezpečnejšia zo všetkých. Odhaľuje plán, ako zmeniť všetky deti na myši pomocou špeciálneho elixíru, ktorý dostanú všetky ostatné čarodejnice. Elixír potom musia naservírovať nenápadne deťom v sladkostiach. Chlapec je potom odhalený zo svojej skrýše a čarodejnice ho premenia na myš. Napriek tomu sa mu spolu s kamarátom Brunom (ktorého tiež premenili) a pomocou starej mamy podarí získať elixír a prekaziť plán čarodejníc tým, že ho nalejú do ich jedla. Všetky čarodejnice sa potom premenili na myši. Hoci zostáva myšou, chlapec sa s tým zmieri a prijme svoj nový život, pretože jeho stará mama ho miluje takého, aký je. Spoločne plánujú cestovať a pokračovať v boji proti zvyšku čarodejníc okolo celého sveta.
