Harry Potter sa vracia do tretieho ročníka v Rokforte, kde sa dozvedá o nebezpečnom väzňovi Siriusovi Blackovi, ktorý ušiel z prísne stráženej väznice Azkaban. Podľa všetkých informácií je Sirius nebezpečný a údajne ide po Harrym, pretože bol spojený s Voldemortom a zradou Harryho rodičov.
V škole sa objavujú desiví strážcovia Azkabanu – dementori, ktorí vysávajú radosť a prinášajú strach. Harry má problém sa s nimi vyrovnať, ale učí sa nové kúzla a postupne silnie. Počas roka sa odhaľujú nové tajomstvá o Harryho minulosti a o tom, čo sa stalo jeho rodičom.
Harry spolu s Ronom a Hermionou začne zisťovať, že pravda o Siriusovi Blackovi možno nie je taká, ako sa zdá. Postupne sa ukazuje, že celý príbeh z minulosti je omnoho zložitejší a že skutočný zradca môže byť niekto úplne iný.
Na konci knihy sa odhalí pravda o Siriusovi, Harry zistí šokujúce informácie o svojej rodine a rozhodnutia, ktoré urobí, zmenia jeho pohľad na minulosť. Príbeh končí silným zvratom a pripravuje ďalšie nebezpečenstvá v čarodejníckom svete.
