Román začína tým, že sa hlavný hrdina Thomas prebudí v temnom výťahu bez spomienok na svoju minulosť. Dostáva sa do prostredia nazývaného Glade, kde žije skupina chlapcov, ktorí sa snažia prežiť obklopení obrovským labyrintom. V prvej časti sa postupne odhaľujú pravidlá fungovania komunity, hierarchia a úlohy jednotlivých členov. Thomas sa rýchlo ukazuje ako zvedavý a odvážny, čo ho odlišuje od ostatných. Zisťuje, že labyrint sa každý deň mení a jeho skúmanie je veľmi nebezpečné. Dôležitú úlohu zohrávajú tzv. Bežci, ktorí mapujú labyrint a hľadajú únikovú cestu. Atmosféra je napätá a plná neistoty, keďže nikto nevie, prečo sa tam nachádzajú. Príchod nových udalostí narúša dovtedajší poriadok v Glade. Thomas začína spochybňovať autority a snaží sa pochopiť pravdu. Prvá časť knihy tak buduje tajomstvo, konflikty a pripravuje pôdu pre ďalší vývoj príbehu.
